1999 年 10 月 17 日，一群伙伴在台大第二學生活動中心成立了「山谷登山會」，整個籌備過程由 79 級蔡日興等伙伴所策劃。當天到場有百餘人，熱鬧非凡。第一任會長由 76 級伙伴林學聖擔任，任內設立了網路辦公室，幫助伙伴申請高嚮證及辦理入山證等事宜。草創前幾年因成員侷限於第三個十年的伙伴，活動較少。2002 年會長改選，最後幾經波折，由紀春興（阿春）伙伴接下第二屆會長。
改變的契機出現於隔年（2003 年）初。當時在校的台大山社學生為推動《南南山語》一書出版而向「山谷登山會」募款，間接與前兩個十年的伙伴聯繫上。原來，第二個十年以林鼎貴伙伴等人為主成立的「榛樹林之歌」網站已於前一年成立；而第一個十年的孫人先伙伴，雖然沒有利用現代的網站或 Email 等方便工具來聯繫，但是憑藉其打電話聯絡的「固樁腳」功力，倒也持續聯繫著一群第一個十年的老伙伴。當《南南山語》的募款消息輾轉傳到人先伙伴耳裡，至此這三個世代的伙伴團體終於恍然大悟——原來大家一直在不同的地方各自牽掛、彼此聯繫著。
經過幾次活動彼此近鄉情怯似地探索與熟悉，後因同年適逢山社四十週年慶，進而演變成盛大的「山社四十年松蘿湖會師」活動（2003/07/26）。兩百多人齊聚在松蘿湖的經典合照，後來成為《山社四十年》社刊的封面與封底照片。2003 年底打鐵趁熱，假台大舊體育館舉辦「山社四十年紀念大會」，數百名國內外伙伴齊聚一堂。
激情過後，歷經 2004 上半年的平靜，伙伴們開始醞釀將「山谷登山會」與「榛樹林之歌」網站及組織進行整併。2004 年底，召開了橫跨一、二、三、四個十年全體伙伴的「山谷大會」，正式昭告老店新開的「山谷登山會」成立，並由眾望所歸的 57 級陳明聰伙伴擔任重組後的第一屆理事長。
此後，山谷登山會由各世代伙伴輪流推舉承擔，並由熱心的伙伴們義務傳承經營至今。除了一年一度的「山谷大會」凝聚大家的情感之外，每五或十年一次的「山谷大會師」更成為跨世代伙伴重返山林、盛大重聚的經典傳統。
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